Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apoa1Q00623 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoa1Q00623 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms