Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSF1Q00613 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSF1Q00613 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSF1Q00613 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms