Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CLTCQ00610 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CLTCQ00610 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLTCQ00610 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLTCQ00610 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CLTCQ00610 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms