Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFAMQ00059 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFAMQ00059 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFAMQ00059 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFAMQ00059 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms