Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apba2P98084 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Apba2P98084 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apba2P98084 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apba2P98084 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apba2P98084 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apba2P98084 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Apba2P98084 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Apba2P98084 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Apba2P98084 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apba2P98084 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apba2P98084 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apba2P98084 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apba2P98084 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apba2P98084 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apba2P98084 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apba2P98084 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apba2P98084 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apba2P98084 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apba2P98084 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms