Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfcP97953 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfcP97953 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VegfcP97953 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfcP97953 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfcP97953 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VegfcP97953 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfcP97953 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VegfcP97953 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VegfcP97953 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfcP97953 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VegfcP97953 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VegfcP97953 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VegfcP97953 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms