Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata5P97489 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata5P97489 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata5P97489 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata5P97489 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gata5P97489 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata5P97489 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gata5P97489 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata5P97489 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gata5P97489 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms