Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bop1P97452 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bop1P97452 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bop1P97452 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bop1P97452 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bop1P97452 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bop1P97452 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bop1P97452 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bop1P97452 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bop1P97452 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Bop1P97452 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Bop1P97452 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bop1P97452 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bop1P97452 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bop1P97452 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bop1P97452 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bop1P97452 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bop1P97452 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bop1P97452 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bop1P97452 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bop1P97452 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bop1P97452 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bop1P97452 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bop1P97452 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bop1P97452 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bop1P97452 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bop1P97452 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bop1P97452 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bop1P97452 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bop1P97452 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bop1P97452 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bop1P97452 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bop1P97452 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bop1P97452 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bop1P97452 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bop1P97452 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bop1P97452 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bop1P97452 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms