Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tubg1P83887 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tubg1P83887 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms