Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIM1P81133 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIM1P81133 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIM1P81133 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIM1P81133 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIM1P81133 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIM1P81133 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIM1P81133 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIM1P81133 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIM1P81133 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIM1P81133 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIM1P81133 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIM1P81133 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIM1P81133 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIM1P81133 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIM1P81133 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIM1P81133 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIM1P81133 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIM1P81133 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIM1P81133 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIM1P81133 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIM1P81133 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SIM1P81133 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIM1P81133 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIM1P81133 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIM1P81133 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIM1P81133 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIM1P81133 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIM1P81133 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIM1P81133 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIM1P81133 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIM1P81133 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIM1P81133 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIM1P81133 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIM1P81133 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIM1P81133 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIM1P81133 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIM1P81133 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIM1P81133 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIM1P81133 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIM1P81133 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIM1P81133 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIM1P81133 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIM1P81133 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIM1P81133 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIM1P81133 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIM1P81133 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIM1P81133 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIM1P81133 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIM1P81133 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIM1P81133 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIM1P81133 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIM1P81133 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIM1P81133 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIM1P81133 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIM1P81133 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIM1P81133 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIM1P81133 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIM1P81133 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIM1P81133 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIM1P81133 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIM1P81133 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIM1P81133 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIM1P81133 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIM1P81133 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIM1P81133 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIM1P81133 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIM1P81133 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIM1P81133 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIM1P81133 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIM1P81133 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIM1P81133 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIM1P81133 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIM1P81133 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIM1P81133 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIM1P81133 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIM1P81133 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIM1P81133 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIM1P81133 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIM1P81133 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIM1P81133 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIM1P81133 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIM1P81133 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIM1P81133 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIM1P81133 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIM1P81133 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIM1P81133 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIM1P81133 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIM1P81133 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SIM1P81133 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SIM1P81133 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIM1P81133 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms