Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx1P81068 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx1P81068 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx1P81068 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx1P81068 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx1P81068 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx1P81068 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx1P81068 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx1P81068 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx1P81068 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx1P81068 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx1P81068 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx1P81068 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms