Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh9P70407 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh9P70407 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh9P70407 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh9P70407 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh9P70407 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh9P70407 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh9P70407 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh9P70407 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh9P70407 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh9P70407 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms