Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tp53bp1P70399 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tp53bp1P70399 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tp53bp1P70399 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms