Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chl1P70232 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chl1P70232 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chl1P70232 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chl1P70232 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chl1P70232 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chl1P70232 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Chl1P70232 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chl1P70232 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chl1P70232 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chl1P70232 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chl1P70232 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chl1P70232 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chl1P70232 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1678.5 ms