Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX1P67809 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX1P67809 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX1P67809 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YBX1P67809 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YBX1P67809 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YBX1P67809 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YBX1P67809 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YBX1P67809 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YBX1P67809 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YBX1P67809 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YBX1P67809 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YBX1P67809 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YBX1P67809 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YBX1P67809 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YBX1P67809 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YBX1P67809 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YBX1P67809 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YBX1P67809 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YBX1P67809 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YBX1P67809 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YBX1P67809 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YBX1P67809 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YBX1P67809 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YBX1P67809 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YBX1P67809 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YBX1P67809 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YBX1P67809 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YBX1P67809 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YBX1P67809 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
YBX1P67809 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YBX1P67809 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
YBX1P67809 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YBX1P67809 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YBX1P67809 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YBX1P67809 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YBX1P67809 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YBX1P67809 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YBX1P67809 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YBX1P67809 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YBX1P67809 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YBX1P67809 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YBX1P67809 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YBX1P67809 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YBX1P67809 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YBX1P67809 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YBX1P67809 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YBX1P67809 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YBX1P67809 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YBX1P67809 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX1P67809 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX1P67809 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX1P67809 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX1P67809 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX1P67809 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YBX1P67809 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX1P67809 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX1P67809 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX1P67809 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YBX1P67809 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX1P67809 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YBX1P67809 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX1P67809 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX1P67809 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX1P67809 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX1P67809 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX1P67809 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX1P67809 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX1P67809 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YBX1P67809 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX1P67809 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX1P67809 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX1P67809 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX1P67809 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX1P67809 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YBX1P67809 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YBX1P67809 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms