Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2IP63279 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2IP63279 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2IP63279 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2IP63279 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms