Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbx1P62878 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbx1P62878 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms