Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3eP60229 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3eP60229 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms