Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCCD1P59942 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCCD1P59942 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCCD1P59942 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms