Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcmtd1P59913 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcmtd1P59913 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd1P59913 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms