Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nphp4P59240 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nphp4P59240 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nphp4P59240 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Nphp4P59240 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Nphp4P59240 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nphp4P59240 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms