Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Csrnp3P59055 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Csrnp3P59055 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Csrnp3P59055 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms