Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCBP4P57723 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCBP4P57723 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCBP4P57723 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms