Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdcd5P56812 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pdcd5P56812 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcd5P56812 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms