Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1P56716 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1P56716 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rp1P56716 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rp1P56716 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1P56716 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rp1P56716 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1P56716 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp1P56716 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1P56716 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp1P56716 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.2 ms