Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX10P56693 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX10P56693 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX10P56693 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX10P56693 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX10P56693 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX10P56693 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX10P56693 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX10P56693 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX10P56693 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX10P56693 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOX10P56693 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX10P56693 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX10P56693 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX10P56693 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX10P56693 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX10P56693 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX10P56693 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOX10P56693 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SOX10P56693 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOX10P56693 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX10P56693 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX10P56693 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX10P56693 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX10P56693 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX10P56693 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOX10P56693 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX10P56693 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX10P56693 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX10P56693 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX10P56693 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX10P56693 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX10P56693 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX10P56693 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX10P56693 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX10P56693 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOX10P56693 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOX10P56693 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SOX10P56693 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX10P56693 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX10P56693 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX10P56693 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX10P56693 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX10P56693 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX10P56693 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX10P56693 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX10P56693 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX10P56693 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX10P56693 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX10P56693 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX10P56693 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX10P56693 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX10P56693 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX10P56693 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX10P56693 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX10P56693 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX10P56693 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX10P56693 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX10P56693 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX10P56693 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX10P56693 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOX10P56693 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOX10P56693 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOX10P56693 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX10P56693 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX10P56693 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX10P56693 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOX10P56693 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOX10P56693 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX10P56693 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX10P56693 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX10P56693 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX10P56693 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX10P56693 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX10P56693 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOX10P56693 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX10P56693 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX10P56693 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX10P56693 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX10P56693 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOX10P56693 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOX10P56693 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX10P56693 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX10P56693 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX10P56693 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX10P56693 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX10P56693 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX10P56693 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX10P56693 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX10P56693 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms