Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf5P56477 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf5P56477 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Irf5P56477 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf5P56477 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irf5P56477 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irf5P56477 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf5P56477 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Irf5P56477 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irf5P56477 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Irf5P56477 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms