Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CartptP56388 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CartptP56388 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CartptP56388 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CartptP56388 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CartptP56388 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CartptP56388 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CartptP56388 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CartptP56388 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CartptP56388 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CartptP56388 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CartptP56388 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CartptP56388 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CartptP56388 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CartptP56388 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CartptP56388 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CartptP56388 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CartptP56388 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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CartptP56388 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CartptP56388 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CartptP56388 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CartptP56388 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CartptP56388 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CartptP56388 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CartptP56388 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CartptP56388 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CartptP56388 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CartptP56388 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CartptP56388 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CartptP56388 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CartptP56388 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CartptP56388 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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CartptP56388 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CartptP56388 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CartptP56388 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CartptP56388 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CartptP56388 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CartptP56388 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CartptP56388 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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CartptP56388 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CartptP56388 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CartptP56388 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CartptP56388 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CartptP56388 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CartptP56388 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CartptP56388 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CartptP56388 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CartptP56388 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CartptP56388 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CartptP56388 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CartptP56388 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CartptP56388 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CartptP56388 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CartptP56388 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CartptP56388 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CartptP56388 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CartptP56388 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CartptP56388 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CartptP56388 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CartptP56388 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CartptP56388 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CartptP56388 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 832 ms