Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp1P56183 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rrp1P56183 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp1P56183 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rrp1P56183 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms