Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUMO3P55854 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SUMO3P55854 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms