Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ELLP55199 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ELLP55199 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
ELLP55199 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ELLP55199 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ELLP55199 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ELLP55199 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ELLP55199 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ELLP55199 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ELLP55199 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELLP55199 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELLP55199 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELLP55199 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELLP55199 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELLP55199 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELLP55199 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELLP55199 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELLP55199 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELLP55199 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELLP55199 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELLP55199 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELLP55199 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELLP55199 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELLP55199 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELLP55199 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELLP55199 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELLP55199 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELLP55199 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELLP55199 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELLP55199 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELLP55199 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELLP55199 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELLP55199 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELLP55199 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELLP55199 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELLP55199 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELLP55199 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELLP55199 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ELLP55199 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELLP55199 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELLP55199 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ELLP55199 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELLP55199 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELLP55199 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELLP55199 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms