Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp1P55194 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp1P55194 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms