Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Abcd3P55096 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcd3P55096 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd3P55096 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms