Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Aqp4P55088 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Aqp4P55088 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aqp4P55088 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms