Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRISP3P54108 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRISP3P54108 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms