Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC16A1P53985 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC16A1P53985 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC16A1P53985 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms