Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP2S1P53680 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP2S1P53680 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms