Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB1P53618 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB1P53618 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB1P53618 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB1P53618 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB1P53618 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB1P53618 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB1P53618 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COPB1P53618 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPB1P53618 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPB1P53618 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPB1P53618 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPB1P53618 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPB1P53618 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB1P53618 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB1P53618 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB1P53618 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB1P53618 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB1P53618 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB1P53618 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPB1P53618 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB1P53618 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB1P53618 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB1P53618 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB1P53618 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB1P53618 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPB1P53618 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COPB1P53618 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COPB1P53618 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB1P53618 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB1P53618 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB1P53618 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPB1P53618 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB1P53618 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB1P53618 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB1P53618 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB1P53618 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB1P53618 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB1P53618 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB1P53618 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB1P53618 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB1P53618 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB1P53618 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB1P53618 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB1P53618 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB1P53618 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB1P53618 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB1P53618 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB1P53618 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB1P53618 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB1P53618 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB1P53618 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB1P53618 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPB1P53618 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPB1P53618 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPB1P53618 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPB1P53618 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPB1P53618 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB1P53618 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB1P53618 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB1P53618 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB1P53618 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB1P53618 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB1P53618 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB1P53618 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB1P53618 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COPB1P53618 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB1P53618 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB1P53618 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB1P53618 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB1P53618 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB1P53618 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB1P53618 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB1P53618 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB1P53618 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB1P53618 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB1P53618 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB1P53618 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB1P53618 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB1P53618 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB1P53618 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB1P53618 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB1P53618 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB1P53618 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB1P53618 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB1P53618 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB1P53618 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB1P53618 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPB1P53618 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
COPB1P53618 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
COPB1P53618 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPB1P53618 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms