Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUCLG1P53597 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SUCLG1P53597 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUCLG1P53597 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms