Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fgd1P52734 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fgd1P52734 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fgd1P52734 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms