Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upp1P52624 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upp1P52624 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Upp1P52624 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upp1P52624 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upp1P52624 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upp1P52624 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upp1P52624 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upp1P52624 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms