Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KPNA2P52292 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA2P52292 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA2P52292 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA2P52292 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA2P52292 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA2P52292 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA2P52292 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA2P52292 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms