Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr1P51675 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccr1P51675 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr1P51675 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms