Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lhx3P50481 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lhx3P50481 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lhx3P50481 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms