Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT3P49368 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT3P49368 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT3P49368 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT3P49368 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT3P49368 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT3P49368 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT3P49368 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT3P49368 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT3P49368 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT3P49368 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT3P49368 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT3P49368 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT3P49368 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT3P49368 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT3P49368 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT3P49368 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT3P49368 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT3P49368 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT3P49368 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT3P49368 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT3P49368 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT3P49368 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT3P49368 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT3P49368 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT3P49368 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT3P49368 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT3P49368 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT3P49368 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT3P49368 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT3P49368 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT3P49368 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT3P49368 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT3P49368 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT3P49368 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT3P49368 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT3P49368 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT3P49368 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT3P49368 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT3P49368 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT3P49368 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT3P49368 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT3P49368 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT3P49368 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT3P49368 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT3P49368 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT3P49368 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT3P49368 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT3P49368 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT3P49368 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT3P49368 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT3P49368 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT3P49368 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT3P49368 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT3P49368 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT3P49368 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT3P49368 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT3P49368 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT3P49368 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT3P49368 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT3P49368 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT3P49368 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT3P49368 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT3P49368 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT3P49368 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT3P49368 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT3P49368 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT3P49368 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT3P49368 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCT3P49368 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT3P49368 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT3P49368 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT3P49368 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT3P49368 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT3P49368 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT3P49368 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT3P49368 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT3P49368 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT3P49368 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT3P49368 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT3P49368 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT3P49368 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT3P49368 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT3P49368 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT3P49368 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT3P49368 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT3P49368 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT3P49368 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT3P49368 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms