Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPINT3P49223 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT3P49223 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT3P49223 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINT3P49223 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.6 ms