Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax9P47242 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax9P47242 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax9P47242 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax9P47242 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax9P47242 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax9P47242 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax9P47242 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax9P47242 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax9P47242 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax9P47242 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pax9P47242 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax9P47242 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax9P47242 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax9P47242 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax9P47242 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax9P47242 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms