Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN2BP42772 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN2BP42772 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN2BP42772 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms