Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN2AP42771 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AP42771 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.3 ms