Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LifrP42703 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LifrP42703 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LifrP42703 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LifrP42703 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LifrP42703 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LifrP42703 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LifrP42703 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LifrP42703 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LifrP42703 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LifrP42703 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LifrP42703 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LifrP42703 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LifrP42703 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LifrP42703 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LifrP42703 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LifrP42703 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LifrP42703 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LifrP42703 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LifrP42703 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LifrP42703 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LifrP42703 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LifrP42703 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LifrP42703 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LifrP42703 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LifrP42703 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LifrP42703 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LifrP42703 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LifrP42703 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LifrP42703 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LifrP42703 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LifrP42703 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LifrP42703 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LifrP42703 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LifrP42703 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LifrP42703 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LifrP42703 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LifrP42703 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LifrP42703 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LifrP42703 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LifrP42703 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LifrP42703 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LifrP42703 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LifrP42703 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LifrP42703 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LifrP42703 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LifrP42703 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LifrP42703 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LifrP42703 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LifrP42703 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LifrP42703 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LifrP42703 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LifrP42703 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LifrP42703 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LifrP42703 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LifrP42703 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LifrP42703 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LifrP42703 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LifrP42703 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LifrP42703 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LifrP42703 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LifrP42703 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LifrP42703 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LifrP42703 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LifrP42703 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LifrP42703 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LifrP42703 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LifrP42703 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LifrP42703 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LifrP42703 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LifrP42703 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LifrP42703 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LifrP42703 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LifrP42703 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LifrP42703 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LifrP42703 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LifrP42703 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LifrP42703 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LifrP42703 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LifrP42703 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LifrP42703 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LifrP42703 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LifrP42703 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LifrP42703 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LifrP42703 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LifrP42703 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LifrP42703 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LifrP42703 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LifrP42703 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LifrP42703 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LifrP42703 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LifrP42703 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LifrP42703 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LifrP42703 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LifrP42703 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LifrP42703 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LifrP42703 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LifrP42703 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LifrP42703 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LifrP42703 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms